Giovanna es egresada de Derecho y lleva más de 15 años ejerciendo la profesión en el servicio público. Actualmente, trabaja como abogada asesora jurídica del Diario Oficial de la República de Chile, institución del Estado encargada de la publicación de las normas jurídicas que rigen al país.
El interés de Aguilera siempre estuvo ligado al ámbito público. Tras egresar, fue abogada asistente en la Municipalidad de Pudahuel; posteriormente trabajó en una Oficina de Protección de los Derechos del Niño (OPD) dependiente del Sename y en Centros de Apoyo a Víctimas del Ministerio del Interior relacionado principalmente a asesoría legal a víctimas de delitos violentos. También fue abogada litigante en los tribunales penales.